# Para generar conf.gro inicial 
# gmx solvate -cs Tr.gro -maxsol 1200 -box 10 10 20 -o conf.gro
# gmx grompp -f EM.mdp
# nice -n +19 gmx mdrun -v -table table_400.xvg
# cp confout.gro conf.gro
# gmx editconf -f conf.gro -box 10 10 40
# cp out.gro conf.gro
#-------------------------------------------------

# Crea 12 T_$i.mdp, cada uno con diferente temperatura a partir de T_0.mdp
#
#j=57.7304
#for i in {1..11..1}
#do
#cp T_0.mdp T_$i.mdp
#j=`echo "$j*1.0235394508" | bc`
#sed -i 's/ref-t                    = 57.7304/ref-t                    = '$j'/g' T_$i.mdp
#sed -i 's/gen-temp                 = 57.7304/gen-temp                 = '$j'/g' T_$i.mdp
#done
#-------------------------------------------------

# Para generar conf_$i.gro iniciales 
#
#for i in {0..11..1}
#do
#gmx grompp -f T_$i.mdp -c conf.gro -o triangle_$i.tpr
#nice -n +19 gmx mdrun -s triangle_$i.tpr -c conf_$i.gro -e ener$i.edr -o traj$i.trr -table table_400 -v
#done
#-------------------------------------------------

# Para generar triangle_$i.gro iniciales 
#
#for i in {0..11..1}
#do
#gmx grompp -f T_$i.mdp -c conf_$i.gro -o triangle_$i.tpr
#done
#-------------------------------------------------

#nice -n +19 mpirun -np 12 gmx_mpi mdrun -s triangle_.tpr -multi 12 -replex 500 -table table_400.xvg -v




